Les troubles du traitement auditif peuvent affecter le développement des fonctions phonologiques et, par conséquent, le développement de la parole et de l'alphabétisation. Il s'agit d'un aspect extrêmement important, en particulier en ce qui concerne l'enfance. Ces troubles peuvent trouver leur origine dans la perception des sons ou dans des lésions des centres corticaux responsables de l'audition normale. Cependant, de nombreuses études menées pour trouver une corrélation entre la perception et les fonctions phonologiques laissent de nombreux doutes et n'apportent pas de réponses claires.